La presenza di un efficace ed efficiente Sistema Qualità costituisce l'aspetto complementare della qualità del dato: il Laboratorio, in sintonia con gli standard europei, in particolare quelli indicati dalla European Environment Agency nel Technical Report "Criteria for EUROAIRNET", ha elaborato, all'interno della partecipazione al CTN-ACE, la "Guida al Manuale della Qualità delle RRQA".

Non sempre il linguaggio della Qualità risulta di semplice comprensione per chi invece pratica il linguaggio tecnico: la Guida si pone quindi l'ambizioso obbiettivo di costituire un ponte tra le due realtà.

La Guida elaborata all'interno del progetto CTN mette in risalto la competenza tecnica del personale coinvolto nel rilevamento della qualità dell'aria ed ha i suoi punti di forza nelle sezioni e procedure che interessano più direttamente l'aspetto tecnico quali la gestione delle apparecchiature (identificazione, taratura e riferibilità, controlli, messa a punto), il processo di rilevamento (campionamento, trattamento dei campioni, analisi, validazione, diffusione dati) e, più in generale, la documentazione della struttura Rete.